En mystisk varelse spränger månen ner till en permanent halvmåne, eleverna i klass 3-E i Kunugigaoka Middle School får då en enorm uppgift: mörda varelsen ansvarig för katastrofen innan jorden lider ett liknande öde. Men monstret, som fått namnet Koro-sensei (oförstörbara lärare) av eleverna, kan flyga i hastigheter upp till Mach 20, som han visar fritt, vilket alla försök att kuva honom i hans utomjordiska damm. Dessutom misfits 3-E snart att upptäcka att den märkliga , tentacled odjuret är mer än bara okuvliga, han är den bästa läraren de någonsin haft!

Anpassad från den humoristiska hit manga av Yuusei Matsui, berättar Ansatsu Kyoushitsu historien om dessa högstadie elever som de polerar sina mord färdigheter och växa för att stå starka mot den förtryckande skolsystemet , sina egna livsproblem, och en dag, Koro- sensei.