Efter att flytta in i den lugna staden Hinamizawa, Maebara Keiichi tillbringar dagarna i skolan och spelar spel med sina lokala vänner. Men skenet kan bedra. En ödesdiger dag, Keiichi hackar på nyheterna om ett mord som hade begåtts i Hinamizawa. Från denna punkt och hemska händelser framför Keiichi, som han snart lär sig hans nära vänner kan inte vara allt som de verkar. Baserat på en amatör mysteriumlek genom 7 Expansion, historien berättas i en serie av olika scenarier.